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    科研合作成果發(fā)表，生物多組學(xué)數據整合分析助力醫學(xué)研究
    2024-05-20
    多組學(xué)數據挖掘在靶點(diǎn)發(fā)現中發(fā)揮著(zhù)至關(guān)重要的作用。通過(guò)整合基因組學(xué)、轉錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)等多個(gè)組學(xué)層面的數據，研究人員可以更全面地理解生物體內分子的相互作用和調控網(wǎng)絡(luò )。這種綜合分析有助于揭示疾病的發(fā)生機制、識別潛在的診斷和治療靶點(diǎn)。近期，熱景生物信息中心在組學(xué)數據研究上有兩篇成果發(fā)表。

    01.《Frontiers in Microbiology》（《微生物學(xué)前沿》）

    “The impact of antibiotic exposure on antibiotic resistance gene dynamics in the gut microbiota of inflammatory bowel disease patients”發(fā)表于Frontiers in Microbiology (DOI:10.3389/fmicb.2024.1382332)。該研究基于宏基因組數據搭建了腸道菌群耐藥性的分析方法，探究了耐藥基因在腸道菌群中的傳播路徑。

    該研究通過(guò)分析抗生素使用前后的腸道菌群狀態(tài)，發(fā)現暴露于抗生素可以誘導IBD患者腸道微生物群組成的改變，特別是益生菌的減少，在停止抗生素后逐漸恢復到新的穩定狀態(tài)。并通過(guò)網(wǎng)絡(luò )分析揭示了耐藥基因的傾向于在分類(lèi)學(xué)上接近的生物體之間轉移。停止使用抗生素后，特異性耐藥基因的流行率和種間流動(dòng)性增加。

    02.《Frontiers in Genetics》（《遺傳學(xué)前沿》）

    “In search of the ratio of miRNA expression as robust biomarkers for constructing stable diagnostic models among multi-center data”發(fā)表在Frontiers in Genetics上(DOI:10.3389/fgene.2024.1381917)。該研究開(kāi)發(fā)了一類(lèi)生物標志物形式，能夠在多中心數據中表現穩健。

    該研究基于轉錄因子介導的miRNA-miRNA相互作用網(wǎng)絡(luò )，構建以miRNA對的表達比率作為樣本特征的標志物篩選方法，用于建立輔助疾病診斷的風(fēng)險評分模型。該方法在多個(gè)多中心數據集中表現優(yōu)越，可以準確的用于疾病早期診斷。

    生信中心為搭建多組學(xué)分析平臺發(fā)表的兩篇文章受到了審稿人和讀者的廣泛關(guān)注。這些研究成果為深入探索生物體系的復雜性和發(fā)現新的生物標志物提供了重要的理論和方法支持。
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